研究人員發(fā)明了一種新方法,可測出人類腫瘤組織中蛋白質的數(shù)量,新成果發(fā)表在4月在線出版的《自然—方法學》(Nature Methods)期刊上。
蛋白質組學是大規(guī)模研究細胞蛋白質的方法,主要使用質譜技術。通過質譜技術,科學家們已經研制出許多測量生物樣品中蛋白質數(shù)量的方法,其中一種方法名為細胞培養(yǎng)氨基酸穩(wěn)定同位素標記SILAC。使用SILAC,生物樣品中的蛋白質被含有“重同位素”的氨基酸所標記,這種被標記的蛋白質在質譜儀中被去除,因此可與未標記的樣品進行比較。這種方法需要非常精確的量化分析。然而,這種方法只適用于能夠完全被重氨基酸所代謝標記的組織或細胞。
Matthias Mann和同事對SILAC方法進行了改進,能夠測出人類原發(fā)性腫瘤中的蛋白質數(shù)量,而這種腫瘤本身不能被代謝標識。包括腫瘤在內的人類組織是由許多種類的細胞組成,它們能在不同水平上表達蛋白質。為了代表取自特定腫瘤中的許多不同類型的細胞和蛋白質,研究小組用重氨基酸標識了含有不同永生人類癌癥細胞系的混合物。采用這種超級SILAC方法,他們精確測出人類腫瘤組織中的蛋白質數(shù)量,包括乳腺癌和腦癌組織。
除了可用于腫瘤生物學以外,超級SILAC方法還可應用于蛋白質生物標識的發(fā)現(xiàn),以檢測早期癌癥。
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