據(jù)悉,根據(jù)2011年6月發(fā)表在《Applied and Environmental Microbiology》雜志上的一篇文章,土壤中的弗蘭克菌屬細菌有產(chǎn)生多種天然產(chǎn)物,包括抗生素、除草劑、色素、抗癌藥物和其他有用產(chǎn)品的潛力。New Hampshire大學微生物學和遺傳學副教授、弗蘭克菌屬專家Louis Tisa,促成了這項研究的基因組分析。
“我們能夠使用尖端技術來鑒別弗蘭克菌屬有機體內的意想不到的化合物,”Tisa說。由Scripps海洋學研究所Bradley Moore領導的研究人員發(fā)現(xiàn)弗蘭克菌屬的基因結構類似于多種的珍貴的天然產(chǎn)物,利用這些天然產(chǎn)物可制造大部分的藥用的天然抗生素。
弗蘭克菌屬是與放線菌植物(包括山毛櫸、櫻桃樹)共生的固氮菌,他們以前沒有被開發(fā)利用,一部分原因是因為這些細菌在實驗室中很難生長。但新的遺傳學的方法使移植弗蘭克的有希望的天然產(chǎn)物的基因至更友好的宿主菌中變得更加容易。
Tisa與他的前研究生、現(xiàn)任實驗室技術員Nicholas Beauchemin在該項目上合作,他說:“我們發(fā)現(xiàn)了一些獨特的、沒有人認為要去這些細菌中尋找的物質。”
Tisa的實驗室提供了促進基因組挖掘的生物學的觀點,基因組挖掘是一個涉及基因序列搜索的最近技術,它對于實驗結果是關鍵的,并且對幾十年不變的艱苦的傳統(tǒng)天然產(chǎn)物藥物發(fā)現(xiàn)是一種補充,Moore說。
該項目增加了一個研究生班,由Moore和共同作者Daniel Udwary(Moore的博士后,現(xiàn)在美國Rhode Island大學)教授“微生物基因組挖掘”。這些學生-論文大多數(shù)的合著者-注釋了他們的基因和以生物合成的原則為基礎,并預測了導致公認的天然產(chǎn)物的途徑。然后,他們于加州California大學Pieter Dorrestein的實驗室工作,Tisa進行了初步的蛋白質組學和代謝組學的分析,以探測預測的途徑是否有效以及小分子的化學性質是否顯而易見。
來源:藥品資訊網(wǎng)信息中心
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